naja, bei einer notbremsung geradeaus und bis zum stillstand sollte das hinterrad eigentlich leicht blockieren! (nicht aber das vorderrad...)
hier gilt ja hinterrad volle kanne rauf und vorderrad dosieren, so stehst du am schnellsten.
ich hatte das problem an meiner 03er duke 2 auch. ich habe dann mal die bremsflüssigkeit gewechselt, welche nur noch eine dickflüssige schwarze suppe war, danach wars deutlich besser! laut ktm händler liegt das zum einen daran das wohl das material das hinteren bremsschlauches nicht ganz optimal gewählt ist, und sich der von innen her ganz langsam "auflöst".
die andere ursache ist sicher das bremsflüssigkeit hygroskopisch ist, das heisst sie ist wasseraufnehmend.
mit zunehmendem alter erhöht sich der wasseranteil in der bremsflüssigkeit.
wenn sich die bremsflüssigkeit jetzt im normalen fahrbetrieb erwärmt bildet das wasser mit der zeit dampfblasen, welche sich verdichten lassen.
das heisst wenn du auf die bremse trittst werden zuerst die dampfblasen zusammengedrückt und erst dann werden die bremsklötze an die scheibe gepresst. dadurch hast du einen längeren pedal- (oder hebel-)weg und zudem ein deutliches bremsfading!
also mindestens alle 2 jahre einmal bremsflüssigkeit wechseln und dabei die hinterradbremse nicht vergessen!